Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcr5Q04683 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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