Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms