Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tff2Q03404 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff2Q03404 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms