Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms