Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms