Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VcpQ01853 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VcpQ01853 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VcpQ01853 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms