Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms