Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja5Q01231 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms