Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms