Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga4Q00651 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms