Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmb4P99026 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmb4P99026 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms