Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brca2P97929 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brca2P97929 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Brca2P97929 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brca2P97929 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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