Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms