Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nbr1P97432 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms