Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Taf1bP97358 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms