Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mesp1P97309 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms