Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arf1P84078 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arf1P84078 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Arf1P84078 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Arf1P84078 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Arf1P84078 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arf1P84078 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Arf1P84078 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms