Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms