Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms