Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms