Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp9xP70398 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp9xP70398 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp9xP70398 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9xP70398 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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