Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad50P70388 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad50P70388 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad50P70388 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms