Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms