Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NficP70255 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NficP70255 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NficP70255 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms