Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms