Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms