Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab3cP62823 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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