Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snrpd3P62320 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms