Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd1P62315 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd1P62315 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms