Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem258P61166 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Tmem258P61166 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Tmem258P61166 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Tmem258P61166 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Tmem258P61166 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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Tmem258P61166 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem258P61166 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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