Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snap25P60879 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms