Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia3P60469 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms