Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P58686 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P58686 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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