Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpf3P58269 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms