Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms