Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp25P57080 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp25P57080 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms