Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TdgP56581 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TdgP56581 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TdgP56581 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TdgP56581 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TdgP56581 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TdgP56581 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TdgP56581 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TdgP56581 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms