Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lim2P56563 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms