Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms