Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2bP55271 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2bP55271 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdkn2bP55271 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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