Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp1P55194 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp1P55194 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp1P55194 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp1P55194 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp1P55194 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp1P55194 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp1P55194 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Sh3bp1P55194 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sh3bp1P55194 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sh3bp1P55194 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sh3bp1P55194 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Sh3bp1P55194 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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