Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GemP55041 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GemP55041 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GemP55041 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GemP55041 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GemP55041 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms