Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23aP54726 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms