Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb3P54285 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb3P54285 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms