Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CnbpP53996 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms