Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Map3k1P53349 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map3k1P53349 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms