Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms