Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdhaP50136 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdhaP50136 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms