Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtpreP49446 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms