Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3P48787 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3P48787 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms